Como metodología, en secundaria utilizamos el método de enseñanza ecléctico, lo que implica una combinación de diferentes prácticas de enseñanza, resaltando los aciertos de cada una de ellas. En el Colegio Nueva Esperanza, predomina una filosof ía humanista, resaltando los valores éticos, morales y espirituales, así como las características individuales de cada estudiante.